Βιοπληροφορικός ερευνητής με εξειδίκευση στην ανάλυση βιοϊατρικών δεδομένων και μηχανική μάθηση. Με υπόβαθρο στη Βιολογία και μεταπτυχιακές σπουδές στην Επιστήμη Δεδομένων, εργάζεται στη διεπαφή της υπολογιστικής βιολογίας και της επιστήμης δεδομένων για την ανακάλυψη νέων γνώσεων από βιολογικά δεδομένα.
Εκπαίδευση
MSc Επιστήμη Δεδομένων & Τεχνολογίες Πληροφορίας, Κατεύθυνση Βιοπληροφορικής - Επιστήμης Βιοϊατρικών Δεδομένων
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Μέσος Όρος: 9.46/10 (Υποτροφία Αριστείας)
Πτυχίο Βιολογίας
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Μέσος Όρος: 7.54/10
Επαγγελματική Εμπειρία
Ερευνητής Βιοπληροφορικής
BSRC Alexander Fleming - Εργαστήριο Pavlopoulos
Ανάπτυξη pipelines MMseqs2, ανάλυση μεταγονιδιωματικών δεδομένων, πρόβλεψη 3D δομών με AlphaFold2
Ερευνητής Μοριακής Γενετικής
BRFAA - Εργαστήριο Syntichaki
Έρευνα τελομερών και αναπαραγωγικής γήρανσης σε C. elegans
Δημοσιεύσεις
Baltoumas FA, Karatzas E, Venetsianou NK, Aplakidou E, Giatras K, et al.
Darling (v2.0): Mining disease-related databases for the detection of biomedical entity associations
Computational and Structural Biotechnology Journal (2025)
View PublicationΣυνέδρια & Εκδηλώσεις
- ELIXIR BioHackathon Europe 2025, Berlin, Germany
- ISMB/ECCB 2025, Liverpool, UK (Co-organizer & trainer - Tutorial VT8: Generative AI for Single-Cell Perturbation Modeling)
- nf-core Distributed Hackathon 2025, BSRC Alexander Fleming, Athens
- ELIXIR BioHackathon Europe 2024, Barcelona, Spain
- 2nd Bio3 Forum, Technopolis Gazi, Athens (2024)
- 71st HSBMB Congress, Athens (2021)
- 31st Panhellenic Conference on AIDS (2019)
Δεξιότητες
Προγραμματισμός
Python, Bash, MATLAB, R, MySQL, Perl
Επιστήμη Δεδομένων / ML
NumPy, pandas, scikit-learn, SciPy, UMAP, TensorFlow, Keras, PyTorch
Βιοπληροφορική
MMseqs2, HMMER, BLAST, AlphaFold2, Foldseek, scanpy, GATK, SAMtools
Γλώσσες
Ελληνικά
Μητρική
Αγγλικά
C2 Proficiency